27 januar, 2006

Vrhunska infrastruktura za metagenomiko

Obeta se nam nov in zmogljiv računalniški center, ki bo ciljno namenjen določitvi genetske kode mikrobnih združb svetovnih oceanov. Projekt bo vodil oddelek  na California Institute for Telecommunications and Information Technology (Calit2) iz sklopa kalifornijske univerze iz San Diega (UCSD). Izveden pa bo v sodelovanju z inštitutom J. Craig Venter (Venter Institute) iz Rockvilla in UCSD centrom CEOA na inštitutu Scripps za oceanografijo. Že nekaj časa vemo, da Craig Venter zbira v svetovnih morjih vzorce mikrobnih združb in da v povezavi s DOE Joint Genome Institutom in s Scripps Genome Center teče sekvenciranje in anotiranje zbranega dednega materiala. Zdaj pa bo ob pomoči državnih sredstev in donacije The Gordon and Betty Moore Foundation nastala računalniška infrastruktura CAMERA (Community Cyberinfrastructure for Advanced Marine Microbial Ecology Research and Analysis). CAMERA bo namenjena raziskavam metagenomike – vrednotenju mikrobnih genskih podatkov ob upoštevanju ekoloških kot tudi fizikalnih in kemijskih pogojev v vzorčevanih okoljih.

Ni komentarjev:

Objavite komentar